Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOM1L2Q6ZVM7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOM1L2Q6ZVM7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms