Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms