Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED8Q6PL24 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms