Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms