Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAMD13Q5VXD3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms