Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms