Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms