Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms