Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms