Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms