Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms