Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms