Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM176BQ3YBM2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms