Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KIAA1644Q3SXP7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KIAA1644Q3SXP7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms