Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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RTL8BQ17RB0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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