Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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