Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDR2Q16832 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms