Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RTN1Q16799 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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