Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms