Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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