Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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