Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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