Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ALX1Q15699 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ALX1Q15699 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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ALX1Q15699 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ALX1Q15699 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ALX1Q15699 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ALX1Q15699 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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