Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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