Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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