Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms