Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NFIXQ14938 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NFIXQ14938 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NFIXQ14938 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NFIXQ14938 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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NFIXQ14938 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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