Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms