Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK13Q14004 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
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