Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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