Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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