Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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