Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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