Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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