Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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