Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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