Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms