Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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