Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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