Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GPS1Q13098 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GPS1Q13098 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GPS1Q13098 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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