Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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