Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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