Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANK3Q12955 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANK3Q12955 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANK3Q12955 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ANK3Q12955 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms