Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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