Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PTPN13Q12923 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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