Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC8Q09428 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms