Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms