Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms