Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms