Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms